Vývoj léku na nový typ koronaviru může podpořit každý, stačí poskytnout GPU svého počítače

Uživatelé nyní mohou věnovat nevyužitý výpočetní výkon svého zařízení zajímavým projektům, který se zabývají vývojem léku proti nemoci COVID-19.

Tlak na vývoj účinného léku je v současné době obrovský a lze předpokládat, že poptávka po něm se bude i nadále zvyšovat. Jeho vývoji se proto začala věnovat celá řada odborníků, vzniklo ale i množství distribuovaných výpočetních projektů zaměřených na hledání léku, které laboratořím v hledání výrazně pomáhají.

I lidé z neodborných řad ale nyní mohou přispět, a to tak, že některému z projektů věnují výpočetní výkon svého počítače. Všechny jednotlivé programy přitom zastřešuje projekt Folding@home, který je pro mnohé uživatele již důvěrně známý.

Princip funguje tak, že jednotlivé projekty využívají výkon domácích počítačů pro výpočty simulace chování složitých molekul. Poznání jejich chování přitom významně napomáhá vývoji účinného léku. Dosud byly podobné projekty využívány při vývoji léků například proti rakovině, Parkinsonově nebo Alzheimerově chorobě. Nyní do Folding@home přibylo právě několik výzkumných projektů analyzujících strukturu a interakce viru SARS-CoV-2 s lidskými buňkami, na základě čehož se hledají látky, které jsou proti němu účinné.

Zapojit se můžete do těchto projektů:

• 11741: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2. atoms: 165550, credit: 15396
• 11746: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2 (alternative structure to 11741). atoms: 182699, credit: 16615
• 11742: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease in complex with an inhibitor. atoms: 62227, credit: 9405
• 11743: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease – potential drug target. atoms: 62180, credit: 9405
• 11744: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain trapped by a SARS-CoV S230 antibody. atoms: 109578, credit: 7608
• 11745: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain mutated to the SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) trapped by a SARS-CoV S230 antibody. atoms: 110370, credit: 7685

Zapojit do projektu se mohou uživatelé s procesorem Intel, AMD, ARM, GPU GeForce a Radeon. Práce na projektech je však určena zejména pro grafické karty (kód Core22 v OpenCL), nejvýhodnější je proto zapojení herních GPU. Aplikace je dostupná pro Windows, Linux a MacOS. Začít s instalací můžete zde.

Připojení do projektu každopádně vyžaduje trochu trpělivosti. V současné době je o podobný typ pomoci velký zájem a může chvíli trvat, než bude právě vašemu počítači přidělena práce.

Zdroj: cnews.cz